Notre microbiote, une partie essentielle de nous même

Résumé : Nous sommes habités par une importante population microbienne située
principalement dans le gros intestin. A titre d’exemple : ces bactéries sont 10 fois plus
nombreuses que les cellules de notre corps, la moitié de nos selles est constituée de bactéries,
le génome de toutes ces bactéries (métagénome) est 100 fois supérieur au nôtre. Cette masse
microbienne est nommée le microbiote et le séquençage de l’ensemble de son génome est très
avancé. Ce sont les projets « métagénome » où la France et l’Europe ont une nette avance
(pour le moment) sur le reste du monde. Pourquoi un tel effort de recherche ? Parce que
notre vie ne serait pas possible sans la présence dans notre tractus digestif de ces populations
bactériennes. De l’équilibre de cet écosystème microbien dépend l’assimilation d’une grande
partie de notre alimentation, la production de vitamines, les flatulences et le confort digestif
mais aussi l’obésité, la détoxication de composés induisant le cancer et les maladies
inflammatoires de l’intestin. De façon plus globale encore, sans microbiote digestif notre
système immunitaire serait atrophié et incapable de répondre aux agents pathogènes. Des
recherches récentes suggèrent aussi que de l’équilibre du microbiote pourrait dépendre une
forme de diabète et, pour une partie, notre comportement. La disponibilité d’outils nouveaux
permet d’analyser maintenant la diversité du microbiote et de ses fonctions. On espère ainsi
lever assez rapidement le voile sur cet inconnu propre à chacun de nous, le microbiote. C’est
le thème de cette brève revue.