L’antibiogramme est un examen de laboratoire permettant d’évaluer la sensibilité d’une bactérie pathogène aux antibiotiques.

Photo : Anne Brisabois

L’antibiorésistance : enjeu majeur dans la lutte contre les maladies bactériennes

L’antibiorésistance est un enjeu majeur dans la lutte contre les maladies bactériennes. Concernant à la fois la santé humaine, la santé animale et la santé environnementale, son étude s’inscrit parfaitement dans le concept « une seule santé » qui s’est développé ces dernières années.

L’émergence des résistances est un phénomène naturel qui a débuté dès le recours aux premiers antibiotiques. Les bactéries disposent de facultés d’adaptation très efficaces qui nécessitent à la fois la mise au point de nouvelles molécules et une grande rigueur dans le choix et l’application des traitements.

Les traitements de longue durée conduisent à l’émergence de bactéries multirésistantes contre lesquelles il devient difficile de lutter. Aussi, il est indispensable de réfléchir à un usage prudent permettant d’épargner les molécules disponibles.

Des plans d’action efficaces

Conscients de l’importance du sujet, les politiques ont mobilisé des moyens qui se sont avérés efficaces pour les animaux d’élevage : les plans Ecoantibio successifs, entre 2012 et 2022, ont permis une réduction de l’exposition de l’ordre de 50 % à tous antibiotiques confondus, et d’environ 90 % aux antibiotiques dits « d’importance critique » pour l’Homme (colistine, céphalosporines de dernières générations, fluoroquinolones). Mais la situation n’est pas aussi favorable pour les animaux de compagnie et la médecine humaine.

Des moyens de contrôle émergent actuellement. Citons en priorité le suivi de l’évolution de la résistance, l’amélioration des moyens de diagnostic pour éviter tout acharnement thérapeutique avec un antibiotique inadapté, l’adaptation des posologies et des schémas thérapeutiques, et la recherche des alternatives. La piste actuelle la plus intéressante est le recours à la vaccination qui a fait ses preuves aussi bien chez l’Homme que chez l’Animal. D’autres pistes sont activement étudiées sans oublier la nécessité d’appliquer des mesures de biosécurité et de désinfection rigoureuses.

Un groupe de veille hepta-académique

Du fait de la menace que représente l’antibiorésistance, les sept Académies concernées (médecine, pharmacie, vétérinaire, agriculture, chirurgie dentaire, chirurgie et sciences) ont créé un groupe de veille qui organise un colloque tous les deux ans.

Les thèmes sont centrés sur différents aspects de ce sujet très large:

- état de la résistance bactérienne dans les différents compartiments (humain, animal, environnemental),

- compréhension des mécanismes de résistance, des modalités de transmission et de diffusion via des éléments génétiques impliqués,

- évaluation des mesures appliquées dans les différents secteurs concernés, en particulier pour trouver pourquoi les résultats chez les animaux d’élevage ont été rapides et spectaculaires, mais le sont beaucoup moins en santé humaine, en particulier à l’hôpital et chez les animaux de sport et de loisir,

- impact des traitements sur les microbiotes avec leurs conséquences sur l’immunité et la santé du nouveau-né,

- inventaire des alternatives disponibles et à développer.

Un prochain colloque aura lieu le 12 juin 2024, intitulé «L’antibiorésistance, l’affaire de tous, de la recherche à la pratique», au cours duquel des avancées de la recherche fondamentale seront présentées avec leur impact potentiel sur les pratiques médicales. Une table ronde sur la nécessité de sensibiliser les étudiants dès le début de leur cursus clôturera ces présentations.

Arlette Laval, membre de l’Académie d’agriculture de France et de l’Académie nationale de pharmacie

Pour participer à ce colloque : L’antibiorésistance, l’affaire de tous ! De la recherche aux pratiques

Antibiotic resistance: a major challenge in the fight against bacterial diseases

Antibiotic resistance is a major issue in the fight against bacterial diseases. It affects human health, animal health and environmental health, and its study fits in perfectly with the "one health" concept that has developed in recent years.

The emergence of resistance is a natural phenomenon that began with the first antibiotics. Bacteria are highly adaptable, requiring both the development of new molecules and great care in the choice and application of treatments.

Long-term treatment leads to the emergence of multi-resistant bacteria that are difficult to combat. It is therefore essential to think about prudent use, so as to spare the molecules available.

Effective action plans

Aware of the importance of the issue, politicians have mobilised resources that have proved effective for farm animals: successive Ecoantibio plans, between 2012 and 2022, have led to a reduction in exposure of around 50% for all antibiotics combined, and around 90% for antibiotics considered 'critically important' for humans (colistin, latest-generation cephalosporins, fluoroquinolones). But the situation is not as favourable for companion animals and human medicine.

Control measures are currently emerging. These include monitoring the development of resistance, improving diagnostic methods to avoid over-treatment with inappropriate antibiotics, adapting doses and treatment regimens, and seeking alternatives. The most interesting current approach is vaccination, which has proved its worth in both humans and animals. Other avenues are being actively explored, not forgetting the need to apply rigorous biosafety and disinfection measures.

A hepta-academic watch group

In view of the threat posed by antibiotic resistance, the seven Academies concerned (Medicine, Pharmacy, Veterinary Medicine, Agriculture, Dentistry, Surgery and Sciences) have set up a watchdog group which organises a symposium every two years.

The themes focus on different aspects of this very broad subject:

- the state of bacterial resistance in different compartments (human, animal, environmental),

- understanding resistance mechanisms, transmission and dissemination methods via the genetic elements involved,

- assessment of the measures applied in the various sectors concerned. In particular, we need to find out why the results in farm animals have been rapid and spectacular, but much less so in human health, particularly in hospitals and in sports and leisure animals,

- the impact of treatments on microbiota, with consequences for immunity and the health of newborn babies,

- an inventory of the alternatives available and those yet to be developed.

The next conference will be held on 12 June 2024, entitled "Antibiotic resistance: everyone's business, from research to practice", at which advances in fundamental research will be presented, along with their potential impact on medical practices. A round-table discussion on the need to raise awareness among students right from the start of their course will round off these presentations.

Arlette Laval, member of the Académie d'agriculture de France and the Académie nationale de pharmacie

To take part in this conference: Antibiotic resistance: everyone's business! From research to practices

L’Ifremer évalue chaque année l’état des populations de poissons pour une pêche plus durable. Mais pour répondre aux besoins alimentaires croissants, de nouvelles espèces devront être domestiquées.

Illustration : Ifremer

Les domestications animales et végétales passées et à venir - 3 avril 2024

La croissance de la population humaine est basée en particulier sur les domestications des plantes et des animaux lors de la révolution néolithique.

La domestication des plantes concerne moins de 20 espèces pour 95% des besoins de l'humanité (blé, riz, maïs, canne à sucre, orge, sorgho, millet, manioc, pomme de terre, légumineuses...). L'alimentation mondiale dépend également de quelques espèces animales (bovins, porcins, ovins, caprins, volailles...).

Aujourd'hui, l'agriculture est contrainte (limites territoriales, adaptation au climat, agroécologie...) et de nombreuses espèces pourraient constituer de nouvelles ressources pour l'avenir. Actuellement, les poissons et les insectes sont les plus étudiés pour l'alimentation.

Pour revoir la séance : Les domestications animales et végétales passées et à venir

Les poils de la tomate sont des trichomes glandulaires qui concentrent des molécules de défense.

Photo : Les jardins de Laurent

Métabolites spécialisés des plantes et agriculture - 24 avril 2024

Comment mieux protéger les plantes contre des maladies, des ravageurs et des stress abiotiques ?

Les plantes peuvent produire elles-mêmes des métabolites spécialisés ayant des rôles physiologiques et écologiques majeurs tout au long de leur cycle de vie. De plus, certains de ces métabolites présentent des effets positifs sur la nutrition et la santé animale et humaine, et constituent des sources de médicaments, de colorants, d’arômes ou de parfums pour l’industrie alimentaire, cosmétique et la santé.

De nouvelles techniques d’amélioration des plantes devraient permettre de réintroduire ces composés de façon raisonnée et optimale dans les plantes cultivées.

Pour revoir la séance : Métabolites spécialisés des plantes et agriculture

De nombreuses terres agricoles sont consommées par l’urbanisation.

Photo : Adobe.stock

La taxation et la rentabilité des terres agricoles en Europe - 15 mai 2024

Cette séance a abordé un sujet important mais assez peu connu : la taxation des terres agricoles. En effet, celle-ci peut influencer la rentabilité des exploitations, le type d’agriculture et au final la destination des terres agricoles.

Aujourd’hui, la souveraineté alimentaire et la protection environnementale nécessitent des arbitrages et l’artificialisation des terres agricoles devient un problème majeur. En France, la taxation des terres est supérieure à la moyenne européenne et leur valeur locative est faible. Avec le départ en retraite de nombreux agriculteurs, cette situation peut donc inciter à la vente des terres pour des usages non agricoles.

Des intervenants ont présenté la situation en Belgique et en Allemagne. Ces comparaisons ont montré des situations contrastées, et posent une question essentielle : en France, ne faudrait-il pas réviser le système de taxation, en particulier pour lutter contre l’artificialisation ?

Pour revoir la séance : La taxation et la rentabilité des terres agricoles en Europe

Le vent oblige les arbres à développer leur ancrage dans le sol par les racines.

Photo : Racines d’arbres - Auvers-sur-Oise - peinture de Vincent Van Gogh (1890)

Le vent, un signal environnemental majeur pour la croissance végétale : de l’aléa à l’adaptation - 22 mai 2024

Le vent a longtemps été considéré comme un facteur mineur de la croissance des plantes cultivées.

Cependant, depuis trois décennies, les travaux en micrométéorologie, biomécanique et mécanobiologie ont permis de mesurer l’ampleur du contrôle de la croissance des plantes par la perception de leur exposition au vent. Ainsi, sur peuplier, 2 600 gènes sont régulés suite à une flexion de tige mimant le vent.

Le vent est donc un facteur agronomique et sylvicole majeur. L’exposition aux effets mécaniques du vent est partiellement modifiable : lisières, haies brise-vent, densité de peuplement… Le cas extrême est celui de la serre : l’absence de stimulation mécanique provoque des effets non désirés de surcroissance en hauteur.

Le vent est un facteur environnemental complexe et l’étude de son impact sur les plantes nécessite une profonde interdisciplinarité.

Pour revoir la séance : Le vent, un signal environnemental majeur pour la croissance végétale

La question environnementale a pris une place déterminante dans la gouvernance foncière.

Photo : Association d’étude et de protection de la nature dans les Vosges

Pourquoi et comment transformer la gouvernance foncière ? - 29 mai 2024

Depuis plusieurs décennies, le rapport à la terre s’est fortement complexifié. Les usages du sol sont variés, les réglementations diverses, les acteurs suivent des intérêts divergents, les instances se sont multipliées.

La question environnementale a pris une place déterminante, qui se traduit par l’importance du code de l’environnement à côté des codes civil, rural ou de l’urbanisme.

Cette séance avait pour thème la gouvernance foncière. Il s’agit d’abord de dégager un diagnostic synthétique sur les enjeux fondamentaux puis d’échanger sur l’harmonisation des rôles de l’État et des collectivités locales pour une gouvernance foncière plus efficace.

Pour revoir la séance : Pourquoi et comment transformer la gouvernance foncière ?

Ferme de 2500 vaches laitières à Frohburg en Allemagne avec 44 robots de traite.

Photo : web-agri - Lely

Développement des très grands troupeaux laitiers dans différents pays du monde : forces motrices, enjeux et impacts - 5 juin 2024

Aux États-Unis comme en Chine, les troupeaux de plus de 1000 vaches assurent désormais près des deux tiers de la collecte laitière.

L’Inde, premier producteur mondial assure son autosuffisance à partir de ses dizaines de millions de micro-troupeaux. Mais elle vient d’afficher son ambition de conquête du marché laitier mondial avec de très grands troupeaux tournés vers l’export.

En France, la question des très grandes fermes laitières semble taboue depuis l’arrêt de l’unique projet à 1000 vaches. C’est la classe des 100-200 vaches qui s’est développée. Cette spécificité française est-elle un handicap pour la compétitivité mondiale ou un atout face aux attentes sociétales?

Pour suivre la séance : Développement des très grands troupeaux laitiers dans différents pays du monde : forces motrices, enjeux et impacts

Chaque année, des événements sont organisés pour sensibiliser le grand public aux multiples enjeux liés à la forêt.

Illustration : visuel de la journée internationale des forêts 2024

La forêt européenne : entre passé et futur - 6 et 7 mai 2024

Aujourd’hui, les citoyens prennent parti pour « leur forêt ».

Ils désirent que leurs paysages forestiers restent inchangés en ignorant les nécessités d’évolution.

La première journée de ce colloque a été consacré aux rapports anciens entre l’Homme et la forêt, puis à leurs évolutions. En effet, avec l’urbanisation, de nouvelles attentes sont apparues : se détendre, se ressourcer, développer des activités sportives…

La seconde journée a permis de détailler les productions forestières et les services environnementaux.

En conclusion, des angles très différents ont été exposés : « la forêt de tous les dangers », « la forêt de tous les bonheurs », avec les points de vue des politiques et des gestionnaires.

Pour en savoir plus : La forêt européenne : entre passé et futur

Les sols ont des fonctions multiples et essentielles.

Illustration : visuel de présentation de la conférence-débat

Les sols et leurs fonctions - 28 mai 2024

Les sols sont le support de la vie terrestre et le substrat de la végétation. Ce sont des écosystèmes complexes et fragiles. Les sols contribuent au stockage et au piégeage du gaz carbonique, au travers de la minéralisation de la matière organique. Ils sont donc un puits de carbone mais peuvent, dans certaines conditions, en libérer.

Après une présentation des enjeux, quatre interventions ont porté sur :

- «Les matières organiques des sols : un levier face au changement climatique»,

- «Le fer, un marqueur du climat dans l’histoire et la dynamique des sols»,

- «Le microbiome des sols face aux changements climatiques»,

- «Les macros invertébrés, acteurs et indicateurs du fonctionnement du sol».

Cette conférence - débat a été organisée conjointement par l’Académie des sciences et l’Académie d’agriculture de France.

Pour en savoir plus : Les sols et leurs fonctions

Visuel du colloque « sensibilité des plantes »

Sensibilité des plantes : mythes et réalités - 31 mai 2024

Ce colloque a été organisé par la Société nationale d’horticulture de France (SNHF).

En effet, depuis peu, les botanistes découvrent que les plantes sont sensibles à leur environnement et comprennent de mieux en mieux les modalités et l’expression de cette sensibilité.

Ce nouveau domaine scientifique concernant les interactions entre les êtres vivants et leur milieu est en pleine expansion.

Ainsi, les plantes sont capables de percevoir leur environnement et de s’y adapter. Cette perception est liée à la lumière, au mouvement, au froid, à l’émission de composés chimiques et au son.

Elles possèdent donc une capacité d’être réactives et de s’adapter. Gardent-elles la mémoire des stress subis antérieurement ?

Pour en savoir plus : Sensibilité des plantes : mythes et réalités

Visuel du colloque «Antibiorésistance»

L’antibiorésistance, l’affaire de tous ! De la recherche aux pratiques - 12 juin 2024 de 9h00 à 17h15

« Les antibiotiques sont des médicaments qui servent à lutter contre les infections dues à des bactéries. Ils ont sauvé et sauvent souvent encore des millions de vies chaque année, mais leur efficacité est menacée car les bactéries peuvent s’adapter et résister au traitement » (Institut Pasteur.)

La résistance aux antibiotiques - ou antibiorésistance - est aujourd’hui un enjeu de santé publique majeur. Un colloque est organisé conjointement par l’Académie d’agriculture de France, l’Académie nationale de chirurgie, l’Académie nationale de chirurgie dentaire, l’Académie nationale de médecine, l’Académie nationale de pharmacie, l’Académie vétérinaire de France et l’Académie des sciences.

En matinée, la première session porte sur la «Recherche et l’état des connaissances scientifiques».

L’après-midi, la seconde session a pour thème : «Aspects européens et internationaux : évolutions récentes».

Une table ronde sera consacrée à un débat général sur «Comment améliorer l’enseignement pour lutter contre l’antibiorésistance : sur le chemin du progrès»

Pour participer sur place à ce colloque, l’inscription est obligatoire auprès du secrétariat de l’Académie d’agriculture.

L’antibiorésistance, l’affaire de tous ! De la recherche aux pratiques

Période de repos entre deux cultures, la jachère fut un élément central au Moyen-Âge pour maintenir la fertilité des sols.

Illustration : miniature du XVe siècle du « Régime des Princes » de Gilles de Rome

Grand Thème 1 :
Cultures végétales

Une nouvelle série consacrée à la fertilité des sols

- La fertilité des sols agricoles :
présentation générale

- Les constituants physiques du sol

- La matière organique :
son rôle essentiel pour la fertilité
(première fiche sur la matière organique)

Par Philippe Viaux

« Notre microbiote, c’est-à-dire les microbes qui sont embarqués en nous, sont peut-être l’endroit où l’effondrement de la biodiversité nous touche le plus ».

Photo : vidéo « l’Homme microbien »

Grand Thème 6 :
Biologie et Biotechnologie

Vidéos de la série « Les microbes, le monde et nous »

- Importance des microbes dans notre santé et alimentation

- Les mycorhizes

- Des champignons entremetteurs

- L'Homme microbien

- Jamais seuls

- Notre empreinte invisible

- La biologie pour comprendre

- Société, histoire et biologie

- L'espoir de l'interdisciplinarité

- Le monde d'après

Par Marc-André Selosse

Grand Thème 8 :
Alimentation et santé humaines

- Vidéo La cuisson des œufs

Par Hervé This

Éditions Presses des Mines.

Agir avec la nature au XIXe siècle. À propos d’oiseaux, d’agriculture et d’émergence de l’écologie

Le débat instauré au milieu du XIXe siècle sur le rôle des oiseaux insectivores en tant qu’auxiliaires de l’agriculture, s’inscrit dans la démarche « agir avec la nature ». Les scientifiques ont fait l’hypothèse que les dégâts causés par les insectes aux cultures, résultaient de l’érosion des populations d’oiseaux insectivores par la chasse et le braconnage. On parlait déjà de la disparition prochaine de plusieurs espèces d’oiseaux de la faune française.

Si la protection des oiseaux est acquise en 1902, la distinction entre utile et nuisible s’est avérée difficile et ce débat perdure. C’est durant cette période que les concepts de l’écologie ont émergé : rôle des facteurs de l’environnement sur la distribution des espèces, équilibre des systèmes écologiques, régulation des populations…

Il y a aujourd’hui de nombreux débats autour de l’érosion de la biodiversité, relayés par les médias avec des chiffres chocs.

En évitant le sensationnel, mieux connaître la biodiversité, c’est en comprendre les déclins et savoir comment agir.

Éditions l’Harmattan.

Une histoire de l’Académie d’agriculture de France - de 1916 à 1960 - Tome 4

Depuis plusieurs années, Christian Ferault poursuit avec opiniâtreté l’histoire de l’Académie d’agriculture de France depuis son origine.

Dans le premier tome (1761-1815), il nous a présenté les fondements de la Société d’agriculture, et ses premiers travaux sur les fléaux sanitaires (carie), la culture du maïs, de la pomme de terre, du sorgho, l’aménagement des forêts…

À la Révolution française, les membres de cette Société ont rédigé un cahier de doléances pour améliorer la vie à la campagne et le sort des journaliers. Ils ont dû aussi lutter pour préserver leur liberté et leur indépendance de pensée.

Dans la période couverte par le second tome (1816-1870), l’agriculture connaît de nombreux progrès : développement des cultures fourragères, des plantes à huile, de la chimie, de la fertilisation…

L’activité des académiciens est permanente et 55 000 pages ont été rédigées à partir de 1837 !

Dans le troisième tome (1871-1915), Christian Ferault présente l’âge d’or de l’Académie, reconnue pour l’importance, la qualité et la diversité de ses travaux. Elle bénéficie du soutien dynamique et efficace de politiques influents. A la pointe du progrès, elle est reconnue au niveau national et à l’étranger.

Le quatrième tome (1915-1960) qui vient de paraître couvre une période de progrès intenses, mais marquée par deux guerres mondiales. La recherche de l’autosuffisance alimentaire est prépondérante. L’Académie se préoccupe des possibilités de diversifier les productions et d’augmenter les rendements. Elle devient la référence de plusieurs générations de chercheurs et d’acteurs du monde agricole.

Grâce à sa démarche d’historien, Christian Ferault enrichit l’histoire de l’agriculture française d’une approche nouvelle issue de volumineuses archives de l’Académie.